紅豆杉屬植物均為國家一級保護植物，紅豆杉屬植物的分類在中國－喜馬拉雅地區(qū)一直比較雜亂，存在較大的爭議，以為這一地區(qū)重要漫衍有須彌紅豆杉、歐洲紅豆杉(T. baccata L.)和密葉紅豆杉(T. fuana Nan Li & R.R. Mill)，種間關系不明確，該地區(qū)紅豆杉的種級職位存在較大的爭議。中國科學院昆明植物研究所高連明博士在國家基金青年基金項目的資助下，對須彌紅豆杉的譜系地理學舉行了研究。重要研究希望如下：

1. 項目組通過對須彌紅豆杉的生計狀態(tài)及資本現(xiàn)狀的深入調查，發(fā)現(xiàn)人為因素可能是導致該物種瀕危的重要緣故原由；

2. 通過對須彌紅豆杉43個居群815個個別舉行了葉綠體trnL-F片斷的測序與分解，共判定出29種葉綠體單倍型。譜系分解解釋，須彌紅豆杉的單倍型具有顯著的生物地理結構(NST =0.768， GST =0.469， P <0.01)。Network分解解釋，29個葉綠體單倍型形成了橫斷山區(qū)和東喜馬拉雅地區(qū)2個譜系，兩個譜系分化的時間約為3.41-7.61Ma，與青藏高原的快速隆升親熱相關。對單倍型的失配分解解釋，橫斷山地區(qū)漫衍的居群在末世冰期后經驗過快速擴張和奠基者效應；而東喜馬拉雅地區(qū)漫衍的居群可能受第四紀的冰期和間冰的頻頻作用，經驗過多次縮短和擴張歷程形成，可能存在多個不同的逃亡所；

3. 基于對須彌紅豆杉43個居群815個個別的9對SSR分子符號的群體遺傳學分解解釋，須彌紅豆杉在物種水平上具有較高的遺傳多樣性，居群間的遺傳分化顯著(Fst=0.217， p<0.001)。單倍型數(shù)據(jù)分解形成的橫斷山和東喜馬拉雅2個譜系得到了SSR數(shù)據(jù)的支持，怒山山脈形成了2個譜系的自然的屏障，阻礙了它們間的基因流。綜合本項目的效果，提出了就地保護應該作為須彌紅豆杉的優(yōu)先保護戰(zhàn)略，遷地保護可作為就地保護的有用彌補。

該項目構建了漫衍于歐亞地區(qū)紅豆杉屬植物的DNA條形碼物種判定數(shù)據(jù)庫，還篩選出了20對可用于須彌紅豆杉譜系地理學和保護遺傳學的SSR分子符號，同時還首次利用分子生物學的方式證實晰紅豆杉屬植物線粒體的遺傳方式不是母系遺傳而是父系遺的結論。同時，揭曉了4篇SCI論文，培育了2名博士研究生。

本項目2021年度已經結題，在我所組織的國家基金項目結題驗收會中綜合評價為優(yōu)異。